(2020年6月18日)
辞職６月１７日付・北海道旅客鉄道株式会社監査役（大臣官房審議官航空局国際担当）堀内丈太郎
大臣官房審議官航空局担当兼航空局総務課長（航空局総務課長）平嶋隆司
辞職（自動車局総務課付）曽根辰美
辞職・横浜川崎国際港湾株式会社担当部長（港湾局港湾経済課港湾利用調整官）関宏治
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(2020年6月17日)
大臣官房付（外務省在オーストラリア日本国大使館参事官）齋藤喬
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(2020年6月16日)
辞職防衛省防衛政策局訓練課長（大臣官房付）佐藤克文
大臣官房付（海事局付）小林健典
自動車局貨物課付（大臣官房人事課付）長瀬洋裕
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(2020年6月15日)
辞職（大臣官房付）西澤明
大臣官房付（外務省在インドネシア日本国大使館一等書記官）富田晃弘
大臣官房人事課付（外務省在中華人民共和国日本国大使館一等書記官）平山翔吾
海事局付・交流派遣株式会社商船三井技術部海洋・中国プロジェクトチームチームエキスパート（海事局海洋・環境政策課長補佐）中村幹
海事局海洋・環境政策課長補佐（資源エネルギー庁省エネルギー・新エネルギー部省エネルギー課長補佐）田中宏和
資源エネルギー庁省エネルギー・新エネルギー部省エネルギー課長補佐出向（海事局検査測度課付）鈴木晋也
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