(2021年12月1日)
原料用営業部長（アルコール営業部長）大沢元
統括管理本部副本部長、佐藤隆史
旭川工場長、中村良輔
生産本部担当部長、増田順之輔
酵素医薬品本部担当部長、中村博英
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(2021年2月1日)
営業本部企画部長（営業部長）専務兼執行役員営業本部長、北條晋也
酵素医薬品事業管掌、専務兼執行役員生産本部長、菅原栄司
北海道支社長（広域営業部長）執行役員、崎谷和治
西日本支社長（首都圏支社長）執行役員、杉山猛
営業本部副本部長兼営業部長（西日本支社長）執行役員、人見学
執行役員首都圏支社長（東北支社長）千葉宗義
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(2020年4月1日)
食品事業本部付審議役兼物流統括部付審議役（食品事業本部付理事兼物流統括部付参事）ヤクルトロジスティクス出向、中村博英
研究開発本部付審議役（研究開発本部付理事兼中央研究所安全性研究所主席研究員）小林稔秀
国際事業本部付審議役兼国際部付審議役（国際事業本部付理事兼）国際部付参事中国ヤクルト㈱出向、松浦祐司
生産本部付審議役（生産管理部長）清野正和
研究開発本部付理事兼中央研究所基盤研究所主席研究員（中央研究所基盤研究所長）松本敏
食品事業本部付理事、東日本支店付参事新潟中央ヤクルト販売㈱出向、鈴木浩
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(2018年4月1日)
監査室長（監査室課長）村上丈治
広報室長（業務部業務課長） 、石黒仁
法務室長（人事部副参事兼人事課長）塚越潤
人事部長（人事部労務厚生課長）松本正俊
人材開発センター所長（北海道支店部長） 、岡崎真也
経理部長（経理部副参事）大後忠
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