(2025年7月15日)
事務次官（文部科学審議官）増子宏（ますこ　ひろし）
文部科学審議官（内閣府科学技術・イノベーション推進事務局統括官）柿田恭良（かきた　やすよし）
官房長（総合教育政策局長）茂里毅（もり　つよし）
総括審議官（文化庁審議官）今泉柔剛（いまいずみ　じゅうごう）
サイバーセキュリティ・政策立案総括審議官（内閣府科学技術・イノベーション推進事務局審議官）藤吉尚之（ふじよし　たかゆき）
総合教育政策局長（研究振興局長）塩見みづ枝（しおみ　みづえ）
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(2021年7月1日)
宇宙開発戦略推進事務局長、河西康之
官房審議官、五味裕一
官房審議官、小川康則
官房審議官、金子正志
科学技術・イノベーション推進事務局審議官兼官房審議官、合田哲雄
官房審議官兼廃炉・汚染水対策担当室次長、竹島睦
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(2018年1月16日)
総務課長、柿田恭良
会計課長、矢野和彦
初等中等教育企画課長、森孝之
財務課長、合田哲雄
医学教育課長、西田憲史
文化庁国語課長、高橋憲一郎
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(2015年1月16日)
研究開発局長（官房審議官＝研究開発局担当）田中正朗
官房審議官＝研究開発局担当（官房政策課長）田口康
官房政策課長（内閣府政策統括官付参事官）板倉周一郎
生涯学習政策局政策課長（大学振興課長）里見朋香
教育課程課長（学術研究助成課長）合田哲雄
国際教育課長（初等中等教育企画課教育制度改革室長）小林万里子
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