(2022年4月1日)
監査室長（監査室副参事兼監査室課長）栗栖康彰
食品品質保証室長（食品品質保証室副参事兼食品品質保証室課長））広藤敏幸
企画室長（直販営業部副参事兼直販企画課長）須藤宏之
広告部長（監査室長）村上丈治
法務室長（法務室副参事）渡辺公久
総務部長（人事部長）松本正俊
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(2020年4月1日)
食品事業本部付審議役兼物流統括部付審議役（食品事業本部付理事兼物流統括部付参事）ヤクルトロジスティクス出向、中村博英
研究開発本部付審議役（研究開発本部付理事兼中央研究所安全性研究所主席研究員）小林稔秀
国際事業本部付審議役兼国際部付審議役（国際事業本部付理事兼）国際部付参事中国ヤクルト㈱出向、松浦祐司
生産本部付審議役（生産管理部長）清野正和
研究開発本部付理事兼中央研究所基盤研究所主席研究員（中央研究所基盤研究所長）松本敏
食品事業本部付理事、東日本支店付参事新潟中央ヤクルト販売㈱出向、鈴木浩
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(2017年4月1日)
広報室ＩＲ室長（広報室ＩＲ室副参事） 、八木伸浩
広告部長（広告部副参事） 、志村真
医薬営業部長（医薬東京第一支店長兼医薬営業部副参事）深谷次郎
国際事業本部提携推進室長、国際部長・、植草俊一
開発部次長（開発部副参事兼研究開発管理課長）野中千秋
中央研究所事務部長、事務部総務課長、関井洋徳
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