(2023年8月1日)
大臣官房付・即日辞職（国土交通政策研究所長）三浦文敬
国土交通政策研究所長（国立研究開発法人海上・港湾・航空技術研究所監事）山口浩孝
（港湾局産業港湾課長）港湾局長、稲田雅裕
（大臣官房審議官/総合政策局担当）政策統括官、小善真司
官房審議官（日本下水道事業団副理事長）井上伸夫
海上保安庁総務部参事官出向/海洋情報部担当（大臣官房付）杉山忠継
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(2023年7月4日)
内閣参事官兼経済安全保障法制準備室参事官、早田豪
内閣参事官兼新型コロナウイルス等感染症対策推進室参事官、小浦克之
内閣参事官、西野健
内閣参事官、谷中謙一
内閣参事官、宮腰奏子
内閣参事官兼空港・港湾水際危機管理チーム参事官、上手研治
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