(2025年10月21日)
建設振興課長（大臣官房付（命）国土交通大臣秘書官事務取扱）山岸浩一
外航課長（大臣官房付（命）国土交通大臣秘書官事務取扱）児玉和久
大臣官房付（命）国土交通大臣秘書官事務取扱（不動産・建設経済局建設振興課長）城麻実
大臣官房付（命）国土交通大臣秘書官事務取扱（海事局外航課長）中川哲宏
水管理・国土保全局上下水道企画課上下水道政策企画官（大臣官房付）辻畑圭亮
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(2025年9月1日)
国土交通大学校長、大沢一夫
東北地方整備局副局長、藤井政人
官房審議官、出口陽一
近畿地方整備局副局長、佐藤忠晴
サイバーセキュリティ・情報化審議官、滝沢謙
海外プロジェクト審議官、川村謙一
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(2025年7月31日)
国土技術政策総合研究所副所長（独立行政法人住宅金融支援機構理事）成田潤也
住宅総合整備課長（住宅局市街地建築課市街地住宅整備室長）勝又賢人
大臣官房付・即日辞職（国土技術政策総合研究所副所長）山下英和
辞職（大臣官房付）髙桒宏之
辞職（総合政策局付）土居佳以
辞職（７月３０日付）（独立行政法人住宅金融支援機構理事）（住宅局住宅総合整備課長）浦口恭直
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(2025年7月16日)
街路交通施設課長（都市局市街地整備課長）筒井祐治
市街地整備課長（都市局都市安全課長）小川博之
都市安全課長（大臣官房付）三浦良平
辞職・７月１５日付・独立行政法人都市再生機構理事、青柳太
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