(2021年7月16日)
大臣官房付・即日辞職（関東運輸局次長）蔭山良幸
関東運輸局次長（総合政策局交通政策課長）中村広樹
交通政策課長（総合政策局物流政策課長）阿部竜矢
物流政策課長（内閣官房内閣参事官内閣官房副長官補付）高田公生
内閣官房内閣参事官内閣官房副長官補付出向（大臣官房付）髙木正人
東北大学法学研究科教授休職（大臣官房付）御手洗潤
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(2020年7月21日)
公共交通・物流政策審議官、久保田雅晴
総括審議官、平岡成哲
航空ネットワーク部長、鶴田浩久
総合政策局次長、大高豪太
北海道運輸局長、加藤進
官房審議官、五十嵐徹人
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(2015年7月1日)
中国地方整備局副局長、坂本努
土地・建設産業局審議官（官庁営繕部審議官）木暮康二
官庁営繕部審議官（同整備課長）羽山真一
北陸信越運輸局長（中部運輸局次長）江角直樹
航空保安大学校長（関西空港事務所長）鏡弘義
東北地方整備局用地部長、向井地博史
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(2013年7月1日)
官房物流審議官（海事局次長）加藤由起夫
海事局次長（人事院人材局交流派遣専門員）桜井俊樹
官房危機管理・運輸安全政策審議官（海上技術安全研究所理事）染矢隆一
官房付（内閣官房副長官補付内閣審議官）石井喜三郎
同（警察庁官房審議官 交通局担当）土屋知省
官房審議官 官庁営繕部担当（官庁営繕部計画課長）西村好文
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